上传蛋白和批量配体,设置对接盒子后开始虚拟筛选
01

靶蛋白

上传用于虚拟筛选的受体结构

PDB

点击上传蛋白文件

已选文件
未上传
02

自定义化合物

上传或粘贴自己的待筛选化合物

已解析化合物
0 个
03

预置筛选库

选择平台准备好的标准筛选库

预置筛选库在超算端已预处理为 PDBQT,将在后续版本接入计算。

对接盒子设置

未手动设置对接盒子时,系统默认包裹整个蛋白。修改中心或尺寸后,3D 视图中的 docking box 会实时更新。

3D 蛋白结构窗口
上传蛋白文件后,将在这里显示蛋白 cartoon、其他结构 stick 和 docking box。
当前模式:自动包裹整个蛋白
对接盒子控制面板 未确认
位点来源 ?
中心坐标 (Å)
Å
Å
Å
盒子大小 (Å)
Å
Å
Å

任务信息

screening-

对接参数

流水线执行进度

蛋白小分子筛选结果

3D 视图将在选择化合物后加载
结合位置
点击排名列表中的"3D"按钮查看化合物在蛋白口袋中的位置。
分子模拟系统 v2.0 | Quick Vina 2