蛋白小分子筛选
额度:加载中...
上传蛋白和批量配体,设置对接盒子后开始虚拟筛选
01
靶蛋白
上传用于虚拟筛选的受体结构
点击上传蛋白文件
02
自定义化合物
上传或粘贴自己的待筛选化合物
点击上传 SMILES 文本文件
支持 TSV/CSV:第一列=SMILES,第二列=ID
点击选择多个配体文件(可多次添加)
03
预置筛选库
选择平台准备好的标准筛选库
预置筛选库在超算端已预处理为 PDBQT,将在后续版本接入计算。
受体结构选择
默认仅蛋白链计入 docking 受体;共晶小分子默认仅作位点参考,但会在 3D 中显示。
化合物 2D 结构展示
未加载
上传配体或输入 SMILES 后,可在这里查看 2D 结构
对接盒子设置
未手动设置对接盒子时,系统默认包裹整个蛋白。修改中心或尺寸后,3D 视图中的 docking box 会实时更新。
3D 蛋白结构窗口
上传蛋白文件后,将在这里显示蛋白 cartoon、其他结构 stick 和 docking box。
当前模式:自动包裹整个蛋白
对接盒子控制面板
未确认
位点来源
中心坐标 (Å)
Å
Å
Å
盒子大小 (Å)
Å
Å
Å
任务信息
screening-